1、按核算項目先整體計算增值額和增值率，確定相應稅率后，再按建筑面積分別核算增值額，計算土地增值稅。

扣除項目=土地成本+住房開發(fā)成本+費用扣除10%+加計扣除20%+稅金=120+600+(120+600)×10%+(120+600)×20%+55=991(萬元)。

增值額=收入-扣除項目=(500+500)-991=9(萬元)。

增值率=增值額÷扣除項目×100%=9÷991×100%=0.9%。低于50%，適用30%的稅率。

由于增值率未高于20%，因此5000平方米普通標準住宅免土地增值稅。

商鋪應納的土地增值稅=9×1000÷6000×30%=0.45(萬元)。

2、先按面積分開項目計算增值額與增值率，再分別確定適用稅率計算增值稅。

普通標準住宅扣除項目=120×5000÷6000+600×5000÷6000+(100+500)×30%+27.5=807.5(萬元)(除稅金及附加外其他按面積分攤)。

普通標準住宅增值額=500-807.5=-307.5(萬元)，無增值額。

商鋪扣除項目=120×1000÷6000+600×1000÷6000+(20+100)×30%+27.5=183.5(萬元);

商鋪增值額=500-183.5=316.5(萬元);

商鋪增值率=316.5÷183.5×100%=172%，適用50%的稅率。

商鋪應納土地增值稅=316.5×50%-183.5×15%=130.725(萬元)。

商鋪土地增值稅計算方法

1、商鋪土地增值稅按照納稅人轉讓房地產(chǎn)所取得的增值額和本條例第七條規(guī)定的稅率計算征收。增值稅稅額＝增值額×增值稅稅率―扣除項目金額×扣除系數(shù)。

2、增值額：納稅人轉讓房地產(chǎn)所取得的收入減除本條例第六條規(guī)定扣除項目金額后的余額，為增值額。增值額＝銷售收入―扣除項目金額。

3、銷售收入：納稅人轉讓房地產(chǎn)所取得的收入，包括貨幣收入、實物收入和其他收入。

4、扣除項目金額：扣除項目金額＝土地款＋開發(fā)成本＋開發(fā)費用＋稅金＋其他扣除項目。

5、增值稅稅率：土地增值稅稅率采用四級超率累進稅率，具體稅率為30％、40％、50％、60％四個檔次。具體應適用哪一級稅率應根據(jù)增值率大小確定。增值率＝增值額÷扣除項目金額×100％。