葉片：前者葉多數(shù)互生，少數(shù)下部的輪生，上部的互生，呈條形。而后者的葉下部的對生，上部的互生，呈披針形后至矩圓狀披針形。莖：前者的莖無毛，而后者的莖基部無毛，中上部都有腺毛。花：前者花為黃色，而后者為紅色或者紫色變至白色。

一、葉片區(qū)別

柳穿魚的葉片多數(shù)互生，少數(shù)下部的輪生，上部的互生，呈條形，長約2-6厘米，寬約2-4毫米。而金魚草的葉片下部的對生，上部的互生，呈披針形后至矩圓狀披針形，大小類似前者，邊緣全緣。

二、莖的區(qū)別

柳穿魚的莖無毛，較直立，通常在上部分枝。而金魚草的莖基部無毛，中上部都有腺毛，基部有時會分枝。

三、花的區(qū)別

柳穿魚為總狀花序，苞片為條形后至狹披針形，花萼裂片為披針形，花冠顏色為黃色。而金魚草的花萼有5深裂，裂片為卵形，花冠的顏色多樣，從紅色或者紫色變至白色。