生長旺盛的南瓜需整枝打叉，不同情況整枝打叉的方法不同。單蔓式適用于早熟品種，側枝全部摘除掉，只留下一個主蔓來結瓜，主蔓上留果2-3個。雙藤蔓式適用于密植的南瓜，主蔓和基部旁邊的側藤蔓保留，另一側的藤蔓去除。多蔓式對于中晚熟的品種較為適用，基部處留有2-3個強的側藤蔓，其余的剪除掉。

一、單蔓式

對于爬地的南瓜來說，一般不需要過多的整枝打叉，但是對于生長較旺盛的植株來說，整枝打叉有利于促進生長，不同情況整枝打叉的方法不同。這個方法主要適用于早熟品種，還有一些種植密集和利用支架種植的南瓜。進行整枝打叉的時候，需要將南瓜上的側枝全部的摘除掉，只留下一個主蔓部分來結瓜，保證每個主蔓上留果2-3個，打頂的位置挑選在最后一個瓜前面留5-6片葉子的地方。

二、雙藤蔓式

這個方法適用于密植的南瓜，一般是用于早熟栽培或土壤條件不好的地塊處。將南瓜的主藤蔓部分保留，還有主藤蔓基部旁邊的側藤蔓也需要保留，將另一側的藤蔓去除掉，可以促進南瓜的坐果率提高。

三、多蔓式

南瓜還可以用多蔓式的方法來整枝打叉，對于中晚熟的品種較為適用。在主藤蔓的基部處留有2-3個強的側藤蔓，在每個側枝蔓上留下1-2個瓜，將其余的側枝剪除掉，還要在生長過密處打散葉子，改善植株的通風透光性。等南瓜的主蔓長到30厘米左右，留下5-6片葉子摘心，再挑選4-5根健壯的側蔓，向周邊伸展。