微生物菌劑肥效持久，可減少化肥施用量，無毒無害。大量施用化肥、農(nóng)藥，使土壤受到不同程度的污染，產(chǎn)生一定的毒性。在污染土壤中生長的作物不僅會造成生長障礙，還會給人類帶來危害。消除土壤污染是環(huán)境治理的重要內(nèi)容。

　　鹽堿地的共同特色是有機(jī)質(zhì)含量低，土壤理化性質(zhì)差，對作物生長有害的陰陽離子多，土壤肥力低，作物促苗困難，鹽堿地不容易發(fā)芽。施肥的一般原則是增加復(fù)合微生物肥料和生物有機(jī)肥的施用，適當(dāng)控制化肥的施用?；蕬?yīng)多施有機(jī)質(zhì)含量高的生物有機(jī)肥，減少化肥施用量，化肥盡量不要靠近種子，以免增加土壤溶液濃度，影響發(fā)芽。根據(jù)情況，避免過度追肥。在條件允許的情況下，可以采取秸稈還田、種植耐鹽堿綠肥等大量措施，減少鹽堿對農(nóng)作物的危害。

　　粘土中一般含有大量的有機(jī)和無機(jī)膠體，土壤保肥能力強(qiáng)，養(yǎng)分不易流失。但粘土供肥慢，施肥后見效慢。這種土壤“老苗不壯”，肥效緩長，土壤緊實(shí)，透氣性差，作物不易生根。這種土壤施用復(fù)合微生物肥料和生物有機(jī)肥，通過豐富的有機(jī)質(zhì)和有益微生物的活動，增加滲透性，提高保肥保水能力。這種土壤性質(zhì)比較渾濁，如果少量未拋光的馬糞配合復(fù)合微生物肥料和生物有機(jī)肥施用，效果會更好。

　　沙地應(yīng)大量施用生物有機(jī)肥，以增加土壤有機(jī)質(zhì)含量，提高保肥能力。由于沙土通風(fēng)良好，土壤溫暖，有機(jī)質(zhì)容易分解，施用未完全分解的有機(jī)肥比施用粘土的影響小。在條件允許的情況下，可以種植耐貧瘠的綠肥來改善土壤的物理和化學(xué)性質(zhì)。

　　微生物菌劑施入土壤后，有益微生物在土壤中快速繁殖，會產(chǎn)生多種對作物有益的代謝產(chǎn)物。這些代謝產(chǎn)物可以刺激或調(diào)節(jié)作物生長，使作物健壯，達(dá)到增產(chǎn)的目的。它不僅能為作物生長提供NPK和中微量元素，還能為作物提供有機(jī)質(zhì)和有益微生物活性菌。此外，微生物菌劑中的一些菌株還可以分泌一些刺激物和維生素來刺激作物生長，使作物健壯，改善營養(yǎng)狀況。